team

Аракелян Арсен Арташесович

д.б.н.

Описание

Арсен Аракелян получил степень к.б.н. в 2004 г. и д.б.н. в 2020 г. по направлению молекулярная и клеточная биология. В 2011 году основал группу геномной биоинформатики, специализирующуюся на разработке алгоритмов и программных пакетов анализа больших геномных данных и их применении в исследованиях молекулярных механизмов хронических заболеваний человека. Является автором более 100 публикаций в рецензируемых научных журналах, членом различных научных сообществ. В 2015 году был избран заведующим кафедрой биоинженерии, биоинформатики и молекулярной биологии Института математики и высоких технологий РАУ и директором Института молекулярной биологии НАН РА. С 2018-2025 гг.. был директором Института биомедицины и фармации РАУ.
 

Научные интересы

  • молекулярная биология
  • секвенирование следующего поколения
  • геномика
  • прецизионная онкология
  • биоинформатика
  • машинное обучение/ИИ

Список основных публикаций

  • Hakobyan S, Schmidt M, Binder H, Arakelyan A. Topology-aware pathway analysis of spatial transcriptomics. PeerJ. 2025 Aug 14;13:e19729. doi: 10.7717/peerj.19729. PMID: 40827204; PMCID: PMC12358110.
  • Zakharyan R, Hakobyan S, Brojakowska A, Bisserier M, Zhang S, Khlgatian MK, Rai AK, Davitavyan S, Stepanyan A, Sirunyan T, Khachatryan G, Sahoo S, Garikipati VNS, Arakelyan A, Goukassian DA. The effects of space radiation on the transcriptome of heart right ventricle tissue. NPJ Microgravity. 2025 Jul 21;11(1):46. doi: 10.1038/s41526-025-00506-8. PMID: 40691149; PMCID: PMC12280083.
  • Hakobyan M, Binder H, Arakelyan A. Telomere Maintenance Pathways in Lower-Grade Gliomas: Insights from Genetic Subtypes and Telomere Length Dynamics. Int J Mol Sci. 2025 Apr 28;26(9):4175. doi: 10.3390/ijms26094175. PMID: 40362411; PMCID: PMC12071676.
  • Arakelyan A, Sirunyan T, Khachatryan G, Hakobyan S, Minasyan A, Nikoghosyan M, Hakobyan M, Chavushyan A, Martirosyan G, Hakobyan Y, Binder H. Assigning Transcriptomic Subtypes to Chronic Lymphocytic Leukemia Samples Using Nanopore RNA-Sequencing and Self-Organizing Maps. Cancers (Basel). 2025 Mar 13;17(6):964. doi: 10.3390/cancers17060964. PMID: 40149301; PMCID: PMC11940626.
  • Stepanyan A, Arakelyan A, Schug J. Transcriptome alterations in long-term mining region residents: Insights into immune response and molecular pathways. Environ Int. 2025 Mar;197:109344. doi: 10.1016/j.envint.2025.109344. Epub 2025 Feb 21. PMID: 40023890.
  • Zakharyan R, Hakobyan S, Brojakowska A, Davitavyan S, Stepanyan A, Sirunyan T, Khachatryan G, Khlgatian MK, Bisserier M, Zhang S, Sahoo S, Hadri L, Garikipati VNS, Arakelyan A, Goukassian DA. Long-lasting sex-specific alteration in left ventricular cardiac transcriptome following gamma and simGCRsim radiation. Sci Rep. 2025 Feb 18;15(1):5963. doi: 10.1038/s41598-025-89815-2. PMID: 39966642; PMCID: PMC11836050.
  • Stepanyan A, Brojakowska A, Zakharyan R, Hakobyan S, Davitavyan S, Sirunyan T, Khachatryan G, Khlgatian MK, Bisserier M, Zhang S, Sahoo S, Hadri L, Rai A, Garikipati VNS, Arakelyan A, Goukassian DA. Evaluating sex-specific responses to western diet across the lifespan: impact on cardiac function and transcriptomic signatures in C57BL/6J mice at 530 and 640/750 days of age. Cardiovasc Diabetol. 2024 Dec 28;23(1):454. doi: 10.1186/s12933-024-02565-9. PMID: 39732652; PMCID: PMC11682651.
  • Hayrapetyan V, Karapetyan L, Ghukasyan L, Atshemyan S, Ghazaryan H, Vardanyan V, Mukuchyan V, Arakelyan A, Zakharyan R. Association of Inflammasome Gene Expression Levels with Pathogenesis of Familial Mediterranean Fever in Armenians. Int J Mol Sci. 2024 Dec 2;25(23):12958. doi: 10.3390/ijms252312958. PMID: 39684669; PMCID: PMC11641286.
  • Ghukasyan L, Khachatryan G, Sirunyan T, Minasyan A, Hakobyan S, Chavushyan A, Hayrapetyan V, Ghazaryan H, Martirosyan G, Mkrtchyan G, Vardanyan V, Mukuchyan V, Davidyants A, Zakharyan R, Arakelyan A. Genewise detection of variants in MEFV gene using nanopore sequencing. Front Genet. 2024 Nov 29;15:1493295. doi: 10.3389/fgene.2024.1493295. PMID: 39678383; PMCID: PMC11638185.
  • Cinar M, Martinez-Medina L, Puvvula PK, Arakelyan A, Vardarajan BN, Anthony N, Nagaraju GP, Park D, Feng L, Sheff F, Mosunjac M, Saxe D, Flygare S, Alese OB, Kaufman JL, Lonial S, Sarmiento JM, Lossos IS, Vertino PM, Lopez JA, El-Rayes B, Bernal-Mizrachi L. Transposon DNA sequences facilitate the tissue-specific gene transfer of circulating tumor DNA between human cells. Nucleic Acids Res. 2024 Jul 22;52(13):7539-7555. doi: 10.1093/nar/gkae427. PMID: 38783375; PMCID: PMC11260451.

Дисциплины