Кафедра Биоинженерии, Биоинформатики И Молекулярной Биологии

Описание

Биоинженерия и биоинформатика – это бурно развивающиеся направления науки о живом, которые возникли на стыке биологии, математики, химии, физики и компьютерных технологий.
В настоящее время накоплен огромный объем информации, включая расшифровку генома, идентификацию популяционных и индивидуальных особенностей генома, раскрытие тонких регуляторных механизмов метаболических реакций и их нарушений, и т.д. При этом возникла существенная потребность в высококвалифицированных кадрах для разработки новых высокопроизводительных аналитических подходов, а также эффективного использования накопленных теоретических данных в области профилактики и ранней диагностики заболеваний, лекарственной токсичности, индивидуальной переносимости и частоты развития побочных эффектов. Для разработки эффективных и современных образовательных программ в области биоинженерии, биоинформатики, ориентированных на внедрение научно-исследовательского компонента в учебный процесс, РАУ и Институтом молекулярной биологии НАН РА была создана совместная научно-образовательная базовая кафедра биоинженерии, биоинформатики и молекулярной биологии.
Цель создания кафедры – объединение усилий РАУ и ИМБ по подготовке, переподготовке и повышению квалификации специалистов по приоритетным направлениям медико-биологической науки на основе инновационных научных исследований в области молекулярно-клеточной и информационной биологии и эффективного использования инновационного потенциала сторон, интеграции ресурсов и возможностей вузовской и академической науки.
 

ПРОГРАММЫ

Описание образовательной программы

Направления подготовки
Специалитет: 
Кафедра занимается подготовкой специалистов по специальности "Биоинженерия и биоинформатика" – 06.05.01. Обучение проводится в очной форме, нормативный срок освоения основной образовательной программы – пять лет. По окончании обучения присваивается квалификация – специалист «Биоинженерии и биоинформатики».

Описание образовательной программы магистратуры
Магистратура: армянский сектор

ԱՌԿԱ ՈՒՍՈՒՑՈՒՄ 
Նկարագրություն
«Կենսաինժեներիայի, կենսաինֆորմատիկայի և մոլեկուլային կենսաբանության ամբիոնն իրականացնում է 051101.14.7 “Գենային ճարտարագիտություն” մագիստրոսական նոր կրթական ծրագիր։ 

Ծրագրի նպատակն է պատրաստել գենային ճարտարագիտության ոլորտում մրցունակ մասնագետների՝ օժտված տեսական և պրակտիկ հմտություններով։ 

Հմտություններ եւ կարողություններ
Ոլորտի վերջին զարգացումների հիման վրա մշակված կրթական ծրագրող ուսանելու արդյունքում մագիստրանտը ձեռք կբերի տեսական և գործնական գիտելիքներ գենային ճարտարագիտություն, սեքվենավորման և գենոմի խմբագրման ոլորտում, կկիրառի դրանք ավարտական գիտահետազոտական աշխատանքի իրականացման համար։ Ստացված գիտելիքները և հմտությունները հնարավորություն կընձեռեն գտնել պահանջված աշխատանք և ունենալ ակնկալվող մասնագիտական աճ։ 

Միջազգային համագործակցություն
Լավագույն ուսանողների համար կստեղծվեն վերապատասրաստման հնարավորություններ գենային ճարտարագիտության ոլորտի արտերկրյա առաջատար գիտահետազոտական և կրթական հաստատություններում։ 

Ընդունելությունը՝ հարցազրույցով 
Ուսման տևողությունը՝ 2 տարի

Լրացուցիչ տեղեկությունների համար դիմել՝
Viber/WhatsApp: +374 94 79 23 01, +374 95 54 20 66

Аспирантура: 
Прием в аспирантуру кафедры ведется по направлению подготовки 1.5.8. "Математическая биология, биоинформатика" (русский сектор) и Գ.00.02 “Կենսաֆիզիկա, կենսաինֆորմատիկա” (армянский сектор). Обучение проводится в очной форме, нормативный срок освоения основной образовательной программы 4 (русский сектор) и 3 года (армянский сектор).
 
ДИСЦИПЛИНЫ, ПРЕПОДАВАЕМЫЕ КАФЕДРОЙ
Специалитет
  1. Молекулярная биология
  2. Микробиология
  3. Вирусология (Virology)
  4. Спецкурс 1
  5. Вводный курс биоинформатики
  6. Клеточная биология
  7. Избранные главы биоинформатики
  8. Иммунология
  9. Базы данных и основные методы биоинформатики
  10. Стат. обработка в биологии
  11. Генетика (Genetics)
  12. Функциональная и структурная аннотация биополимеров 
  13. Популяционная генетика
  14. Машинное обучение
  15. Вычислительная биология
  16. Цитогенетика
  17. Биоинженерия микроорганизмов
  18. Молекулярное моделирование 
  19. Спецкурс 2 (Хемоинформатика)
  20. Клеточная инженерия 
  21. Теория эволюции
  22. Спецкурс 3 (Геномная инженерия)
  23. Геномика и протеомика 
  24. Белковая инженерия и нанобиотехнология
  25. Драг дизайн
  26. Анализ данных массово-параллельных экспериментов
  27. Программирование в среде R
 
Практики и ГИА
  1. Введение в молекулярную биологию (Учебная практика по работе в биологических лабораториях) 
  2. Введение в генетику (Учебная практика) 
  3. Практика по получению профессиональных умений и опыта профессиональной деятельности (Производственная практика)        
  4. Научно-исследовательская работа (Производственная практика)      
  5. Преддипломная практика (Производственная практика)
  6. Выполнение и защита выпускной квалификационной работы













 

team

Аракелян Арсен Арташесович

д.б.н.

Информация

Арсен Аракелян получил степень к.б.н. в 2004 г. и д.б.н. в 2020 г. по направлению молекулярная и клеточная биология. В 2011 году основал группу геномной биоинформатики, специализирующуюся на разработке алгоритмов и программных пакетов анализа больших геномных данных и их применении в исследованиях молекулярных механизмов хронических заболеваний человека. Является автором более 100 публикаций в рецензируемых научных журналах, членом различных научных сообществ. В 2015 году был избран заведующим кафедрой биоинженерии, биоинформатики и молекулярной биологии Института математики и высоких технологий РАУ и директором Института молекулярной биологии НАН РА. С 2018-2025 гг.. был директором Института биомедицины и фармации РАУ.
 

Научные интересы

  • молекулярная биология
  • секвенирование следующего поколения
  • геномика
  • прецизионная онкология
  • биоинформатика
  • машинное обучение/ИИ

Список основных публикаций

  • Hakobyan S, Schmidt M, Binder H, Arakelyan A. Topology-aware pathway analysis of spatial transcriptomics. PeerJ. 2025 Aug 14;13:e19729. doi: 10.7717/peerj.19729. PMID: 40827204; PMCID: PMC12358110.
  • Zakharyan R, Hakobyan S, Brojakowska A, Bisserier M, Zhang S, Khlgatian MK, Rai AK, Davitavyan S, Stepanyan A, Sirunyan T, Khachatryan G, Sahoo S, Garikipati VNS, Arakelyan A, Goukassian DA. The effects of space radiation on the transcriptome of heart right ventricle tissue. NPJ Microgravity. 2025 Jul 21;11(1):46. doi: 10.1038/s41526-025-00506-8. PMID: 40691149; PMCID: PMC12280083.
  • Hakobyan M, Binder H, Arakelyan A. Telomere Maintenance Pathways in Lower-Grade Gliomas: Insights from Genetic Subtypes and Telomere Length Dynamics. Int J Mol Sci. 2025 Apr 28;26(9):4175. doi: 10.3390/ijms26094175. PMID: 40362411; PMCID: PMC12071676.
  • Arakelyan A, Sirunyan T, Khachatryan G, Hakobyan S, Minasyan A, Nikoghosyan M, Hakobyan M, Chavushyan A, Martirosyan G, Hakobyan Y, Binder H. Assigning Transcriptomic Subtypes to Chronic Lymphocytic Leukemia Samples Using Nanopore RNA-Sequencing and Self-Organizing Maps. Cancers (Basel). 2025 Mar 13;17(6):964. doi: 10.3390/cancers17060964. PMID: 40149301; PMCID: PMC11940626.
  • Stepanyan A, Arakelyan A, Schug J. Transcriptome alterations in long-term mining region residents: Insights into immune response and molecular pathways. Environ Int. 2025 Mar;197:109344. doi: 10.1016/j.envint.2025.109344. Epub 2025 Feb 21. PMID: 40023890.
  • Zakharyan R, Hakobyan S, Brojakowska A, Davitavyan S, Stepanyan A, Sirunyan T, Khachatryan G, Khlgatian MK, Bisserier M, Zhang S, Sahoo S, Hadri L, Garikipati VNS, Arakelyan A, Goukassian DA. Long-lasting sex-specific alteration in left ventricular cardiac transcriptome following gamma and simGCRsim radiation. Sci Rep. 2025 Feb 18;15(1):5963. doi: 10.1038/s41598-025-89815-2. PMID: 39966642; PMCID: PMC11836050.
  • Stepanyan A, Brojakowska A, Zakharyan R, Hakobyan S, Davitavyan S, Sirunyan T, Khachatryan G, Khlgatian MK, Bisserier M, Zhang S, Sahoo S, Hadri L, Rai A, Garikipati VNS, Arakelyan A, Goukassian DA. Evaluating sex-specific responses to western diet across the lifespan: impact on cardiac function and transcriptomic signatures in C57BL/6J mice at 530 and 640/750 days of age. Cardiovasc Diabetol. 2024 Dec 28;23(1):454. doi: 10.1186/s12933-024-02565-9. PMID: 39732652; PMCID: PMC11682651.
  • Hayrapetyan V, Karapetyan L, Ghukasyan L, Atshemyan S, Ghazaryan H, Vardanyan V, Mukuchyan V, Arakelyan A, Zakharyan R. Association of Inflammasome Gene Expression Levels with Pathogenesis of Familial Mediterranean Fever in Armenians. Int J Mol Sci. 2024 Dec 2;25(23):12958. doi: 10.3390/ijms252312958. PMID: 39684669; PMCID: PMC11641286.
  • Ghukasyan L, Khachatryan G, Sirunyan T, Minasyan A, Hakobyan S, Chavushyan A, Hayrapetyan V, Ghazaryan H, Martirosyan G, Mkrtchyan G, Vardanyan V, Mukuchyan V, Davidyants A, Zakharyan R, Arakelyan A. Genewise detection of variants in MEFV gene using nanopore sequencing. Front Genet. 2024 Nov 29;15:1493295. doi: 10.3389/fgene.2024.1493295. PMID: 39678383; PMCID: PMC11638185.
  • Cinar M, Martinez-Medina L, Puvvula PK, Arakelyan A, Vardarajan BN, Anthony N, Nagaraju GP, Park D, Feng L, Sheff F, Mosunjac M, Saxe D, Flygare S, Alese OB, Kaufman JL, Lonial S, Sarmiento JM, Lossos IS, Vertino PM, Lopez JA, El-Rayes B, Bernal-Mizrachi L. Transposon DNA sequences facilitate the tissue-specific gene transfer of circulating tumor DNA between human cells. Nucleic Acids Res. 2024 Jul 22;52(13):7539-7555. doi: 10.1093/nar/gkae427. PMID: 38783375; PMCID: PMC11260451.

Дисциплины