Лаборатория структурной биоинформатики

Описание Сотрудники Публикации Гранты Галерея


Буклет Лаборатории 

Цель Лаборатории:
Целью лаборатории является научно-исследовательская деятельность в области биомоделирования и процессов, проходящих в медико-биологических молекулярных системах.

Лаборатория структурной биоинформатики ИБиФ РАУ решает следующие научно- исследовательские задачи:
  • in silico исследование физико-химических и фармакокинетических параметров соединений различной природы (параметры ADME).
  • Первичная in silico оценка токсичности соединений.
  • Проведение систематического поиска, для выявления и идентификации комплементарности сайтов связывания, для системы лиганд-мишень. Виртуальный скрининг лигандов на основе фармакофора.
  • Конструирование и модификация биоактивных соединений на основе фармакофора с использованием методов хемоинформатики (дизайн лекарственных соединений).
  • Предсказание, определение и валидация молекулярных мишеней (белков и нуклеиновых кислот), для исследуемых классов соединений (Виртуальный скрининг мишени).
  • Конформационный поиск наилучшей и достоверной ориентации лиганда при комплексообразовании лиганд -мишень (Молекулярный докинг)
  • in silico моделирование взаимодействий системы лиганд- мишень в реальном времени с учетом параметров близких к реальным (Молекулярная динамика).
  • Предсказание селективности связывания и спектра действия лигандов различной природы на основании анализа виртуальных взаимодействий (статистическая обработка биологической информации).
 Научные интересы лаборатории охватывает следующие области:
    • Нейродегенеративные заболевания человека и животных (болезнь Альцгеймера, Паркинсон).
    • Метаболические заболевания человека и животных (патогенез сахарного диабета и поиск антидиабетических агентов различной природы.
    • in silico разработка и оценка противосудорожных биоактивных соединений.
    • Хемоинформатика противоопухолевых соединений.
    • Базы данных биоактивных соединений.

Гранты:
2021г. Финансовая поддержка Мин.обр.науки России в рамках государственного задания по теме «Реализации комплекса мер по повышению эффективности деятельности Российско-Армянского (Славянского) и Белорусско-Российского университетов» (ДС от 08.07.21 № 075-03-2021-050/5) 

2021-2024 гг. «Синтез потенциально биологически активных новых производных пиридина, реакции перегруппировки и молекулярное моделирование» По договорному (тематическому) финансированию научно-технической деятельности по коду «20TTWS-1D032» Комитет по науке Министерства образования, науки, культуры и спорта РА.

2021-2023гг. «Разработка и применение ионных жидкостей в химии» Научные темы для поддержки научных групп код: «20TTSG-1D011» Комитет по науке Министерства образования, науки, культуры и спорта РА.

2021-2023гг. Исследования в области комбинированных пиридинов, содержащих азот, кислород и серу. Синтез, преобразование и молекулярное моделирование. По договорному (тематическому) финансированию научно-технической деятельности по коду «21T‐1D231» Комитет по науке Министерства образования, науки, культуры и спорта РА.
Соглашения о научно-исследовательском сотрудничестве:

2019-2024 гг. - Лаборатория молекулярной нейродегенерасции, Санкт-Петербургского Политехнического Университета, Санкт-Петербург, Россия.

2020-2025 гг. - Кафедра общей и биологической химии ФГБОУ ВО Ставропольский Государственный Медицинский Университет. Ставрополь, Россия.

2021-2026 гг. – Научно-технологический Центр Органической и Фармацевтической Химии НАН РА

 
Сотрудники лаборатории


Унанян Лерник Суренович,
lernik.hunanyan@rau.am
Должность к.б.н., руководитель лаборатории Структурной биоинформатики ИБМиФ РАУ
Интересы: Структурная биоинформатика, биофизика, хемоинформатика, молекулярное моделирование

Макичян Ани Тиграновна
ani.makichyan@rau.am
Аспирант 4-ого года обучения, кафедры фармацевтической химии ИБМиФ РАУ,
Должность: младший научный сотрудник.
Интересы:Органическая и биоорганическая химия, хемоинформатика, хемогеномика

Камарян Виктор Самвелович
viktor.ghamaryan@rau.am
Аспирант 2- ого года обучения, кафедры биоинженерии, биоинформатики и молекулярной биологии ИБМиФ РАУ
Должность: младший научный сотрудник
Интересы: Биоинформатика, молекулярная биология, молекулярное моделирование,

Аракелян Лиана Ашотовна
liana.arakelyan@rau.am
Выпускница 2022  года, Кафедры биоинженерии, биоинформатики и молекулярной биологии ИБМиФ РАУ
Должность: лаборант
Интересы: Хемоинформатика, хемогеномика, молекулярное моделирование.

ИЗБРАННЫЕ ПУБЛИКАЦИИ (2019-2021)
 
  1. В.О. Топузян, В.М. Казоян, Л.С. Унанян, А.А.Оганесян, Л.Х. Галстян, А.Т. Макичян//     Некоторые подходы к синтезу 1,2,4-тризамещенных 5-имидазолонов с применением силилирующих агентов и изучение их антихолинэстеразных свойств// Хим. ж. Арм., 2019, т. 72, N 1-2, c. 159-175.
  2. Hunanyan L.S., Makichyan A.T., Topuzyan V.O.,Kazoyan V.M., Hovhannisyan A.A. study of anticholinesterase activity of newly synthesized bioactive compounds on the basis of 1-aryl -5- imidazolon  by the methods of molecular modeling
  3. L. Hunanyan , A.Makichyan , V Ghamaryan , A. Hrutyunyan G. Danagulyan (2019) Preliminary evaluation of the biological activity of benzo [4′,5′] imidazo [2′, 1′: 6,1] pyrido [2,3-d] pyrimidine derivatives by the methods of molecular modeling, Chemical Journal of Armenia, 72, №4, p. 530-533, 2019
  4. E.G. Paronikyan, S.Sh. Dashyan, S.S. Mamyan, R.G. Paronikyan, I.M. Nazaryan, H.H. Hakopyan, L.S. Hunanyan, A.T. Makichyan,V.S.Ghamaryan, Evaluation of neurotropic activity and molecular docking study of new derivatives of pyrano[4'',3'':4',5']pyrido[3',2':4,5]thieno[3,2-d]pyrimidines on the basis of pyrano[3,4-c] pyridines/Bioorganic & Medicinal Chemistry/v.28.Iss.17, https:// doi.org/ 10.1016/j.bmc.2020.156432 (2020)
  5. K.S. Elbekyan, F. A. Bidzhiyeva, L.S. Hunanyan, Influence of melatonin on the processes of tissue energy supply in diabetes mellitus// Pr. M & Sci. Developments I (4) p.119-124 (2020) doi: 10.34660/INF.2020.31.41.001.
  6. В.С. Камарян, Л.С. Унанян, Е.А. Попугаева in silico скрининг и докинг потенциальных активаторов TRPC6 на основе фармакофора N-N- дизамещенных пиперазинов, сборник научных трудов XXVII симпозиума «биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» – Москва: Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, 2021 стр. 50 DOI: 10.18097/BCADD2021.
  7. Мовсисян Ч.Г., Камарян В.С., Унанян Л.С., Овакимян А.С., Разработка программы конформационного анализа и визуализации результатов молекулярного докинга с использованием методов кластеризации, Вестник РАУ № 1, стр.165-176, 2021

Галерея

            

   

    

   

   
 
  
 
​​​