Буклет Лаборатории
Цель Лаборатории:
Целью лаборатории является научно-исследовательская деятельность в области биомоделирования и процессов, проходящих в медико-биологических молекулярных системах.
Лаборатория структурной биоинформатики ИБиФ РАУ решает следующие научно- исследовательские задачи:
-
in silico исследование физико-химических и фармакокинетических параметров соединений различной природы (параметры ADME).
-
Первичная in silico оценка токсичности соединений.
-
Проведение систематического поиска, для выявления и идентификации комплементарности сайтов связывания, для системы лиганд-мишень. Виртуальный скрининг лигандов на основе фармакофора.
-
Конструирование и модификация биоактивных соединений на основе фармакофора с использованием методов хемоинформатики (дизайн лекарственных соединений).
-
Предсказание, определение и валидация молекулярных мишеней (белков и нуклеиновых кислот), для исследуемых классов соединений (Виртуальный скрининг мишени).
-
Конформационный поиск наилучшей и достоверной ориентации лиганда при комплексообразовании лиганд -мишень (Молекулярный докинг)
-
in silico моделирование взаимодействий системы лиганд- мишень в реальном времени с учетом параметров близких к реальным (Молекулярная динамика).
-
Предсказание селективности связывания и спектра действия лигандов различной природы на основании анализа виртуальных взаимодействий (статистическая обработка биологической информации).
Научные интересы лаборатории охватывает следующие области:
-
-
Нейродегенеративные заболевания человека и животных (болезнь Альцгеймера, Паркинсон).
-
Метаболические заболевания человека и животных (патогенез сахарного диабета и поиск антидиабетических агентов различной природы.
-
in silico разработка и оценка противосудорожных биоактивных соединений.
-
Хемоинформатика противоопухолевых соединений.
-
Базы данных биоактивных соединений.
Гранты:
2021г. Финансовая поддержка Мин.обр.науки России в рамках государственного задания по теме «Реализации комплекса мер по повышению эффективности деятельности Российско-Армянского (Славянского) и Белорусско-Российского университетов» (ДС от 08.07.21 № 075-03-2021-050/5)
2021-2024 гг. «Синтез потенциально биологически активных новых производных пиридина, реакции перегруппировки и молекулярное моделирование» По договорному (тематическому) финансированию научно-технической деятельности по коду «20TTWS-1D032» Комитет по науке Министерства образования, науки, культуры и спорта РА.
2021-2023гг. «Разработка и применение ионных жидкостей в химии» Научные темы для поддержки научных групп код: «20TTSG-1D011» Комитет по науке Министерства образования, науки, культуры и спорта РА.
2021-2023гг. Исследования в области комбинированных пиридинов, содержащих азот, кислород и серу. Синтез, преобразование и молекулярное моделирование. По договорному (тематическому) финансированию научно-технической деятельности по коду «21T‐1D231» Комитет по науке Министерства образования, науки, культуры и спорта РА.
Соглашения о научно-исследовательском сотрудничестве:
2019-2024 гг. - Лаборатория молекулярной нейродегенерасции, Санкт-Петербургского Политехнического Университета, Санкт-Петербург, Россия.
2020-2025 гг. - Кафедра общей и биологической химии ФГБОУ ВО Ставропольский Государственный Медицинский Университет. Ставрополь, Россия.
2021-2026 гг. – Научно-технологический Центр Органической и Фармацевтической Химии НАН РА
Сотрудники лаборатории
Унанян Лерник Суренович,
lernik.hunanyan@rau.am
Должность к.б.н., руководитель лаборатории Структурной биоинформатики ИБМиФ РАУ
Интересы: Структурная биоинформатика, биофизика, хемоинформатика, молекулярное моделирование
Макичян Ани Тиграновна
ani.makichyan@rau.am
Аспирант 4-ого года обучения, кафедры фармацевтической химии ИБМиФ РАУ,
Должность: младший научный сотрудник.
Интересы:Органическая и биоорганическая химия, хемоинформатика, хемогеномика
Камарян Виктор Самвелович
viktor.ghamaryan@rau.am
Аспирант 2- ого года обучения, кафедры биоинженерии, биоинформатики и молекулярной биологии ИБМиФ РАУ
Должность: младший научный сотрудник
Интересы: Биоинформатика, молекулярная биология, молекулярное моделирование,
Аракелян Лиана Ашотовна
liana.arakelyan@rau.am
Выпускница 2022 года, Кафедры биоинженерии, биоинформатики и молекулярной биологии ИБМиФ РАУ
Должность: лаборант
Интересы: Хемоинформатика, хемогеномика, молекулярное моделирование.
ИЗБРАННЫЕ ПУБЛИКАЦИИ (2019-2021)
-
В.О. Топузян, В.М. Казоян, Л.С. Унанян, А.А.Оганесян, Л.Х. Галстян, А.Т. Макичян// Некоторые подходы к синтезу 1,2,4-тризамещенных 5-имидазолонов с применением силилирующих агентов и изучение их антихолинэстеразных свойств// Хим. ж. Арм., 2019, т. 72, N 1-2, c. 159-175.
-
Hunanyan L.S., Makichyan A.T., Topuzyan V.O.,Kazoyan V.M., Hovhannisyan A.A. study of anticholinesterase activity of newly synthesized bioactive compounds on the basis of 1-aryl -5- imidazolon by the methods of molecular modeling
-
L. Hunanyan , A.Makichyan , V Ghamaryan , A. Hrutyunyan G. Danagulyan (2019) Preliminary evaluation of the biological activity of benzo [4′,5′] imidazo [2′, 1′: 6,1] pyrido [2,3-d] pyrimidine derivatives by the methods of molecular modeling, Chemical Journal of Armenia, 72, №4, p. 530-533, 2019
-
E.G. Paronikyan, S.Sh. Dashyan, S.S. Mamyan, R.G. Paronikyan, I.M. Nazaryan, H.H. Hakopyan, L.S. Hunanyan, A.T. Makichyan,V.S.Ghamaryan, Evaluation of neurotropic activity and molecular docking study of new derivatives of pyrano[4'',3'':4',5']pyrido[3',2':4,5]thieno[3,2-d]pyrimidines on the basis of pyrano[3,4-c] pyridines/Bioorganic & Medicinal Chemistry/v.28.Iss.17, https:// doi.org/ 10.1016/j.bmc.2020.156432 (2020)
-
K.S. Elbekyan, F. A. Bidzhiyeva, L.S. Hunanyan, Influence of melatonin on the processes of tissue energy supply in diabetes mellitus// Pr. M & Sci. Developments I (4) p.119-124 (2020) doi: 10.34660/INF.2020.31.41.001.
-
В.С. Камарян, Л.С. Унанян, Е.А. Попугаева in silico скрининг и докинг потенциальных активаторов TRPC6 на основе фармакофора N-N- дизамещенных пиперазинов, сборник научных трудов XXVII симпозиума «биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» – Москва: Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, 2021 стр. 50 DOI: 10.18097/BCADD2021.
-
Мовсисян Ч.Г., Камарян В.С., Унанян Л.С., Овакимян А.С., Разработка программы конформационного анализа и визуализации результатов молекулярного докинга с использованием методов кластеризации, Вестник РАУ № 1, стр.165-176, 2021